MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae) plasmid pLeu

Total Repeats: 248

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017261	ATA	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017261	T	6	6	24	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017261	A	6	6	30	35	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017261	T	9	9	45	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017261	TA	3	6	59	64	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017261	T	7	7	65	71	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017261	ATTT	2	8	72	79	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017261	TTA	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017261	TAA	2	6	120	125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017261	A	7	7	124	130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017261	T	6	6	152	157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017261	A	6	6	160	165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017261	TAA	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017261	A	9	9	177	185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017261	TAAAAA	2	12	193	204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017261	A	11	11	200	210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017261	ATATA	2	10	228	237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017261	A	6	6	256	261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017261	A	6	6	278	283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017261	A	7	7	290	296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017261	T	6	6	297	302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017261	A	9	9	303	311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017261	TGTT	2	8	332	339	0 %	75 %	25 %	0 %	384228028
24	NC_017261	T	7	7	378	384	0 %	100 %	0 %	0 %	384228028
25	NC_017261	CTA	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228028
26	NC_017261	GAA	2	6	443	448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228028
27	NC_017261	CTT	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228028
28	NC_017261	TCT	2	6	498	503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228028
29	NC_017261	T	6	6	547	552	0 %	100 %	0 %	0 %	384228028
30	NC_017261	ATCC	2	8	631	638	25 %	25 %	0 %	50 %	384228028
31	NC_017261	TTG	2	6	642	647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228028
32	NC_017261	T	6	6	648	653	0 %	100 %	0 %	0 %	384228028
33	NC_017261	TTA	2	6	659	664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228028
34	NC_017261	A	6	6	693	698	100 %	0 %	0 %	0 %	384228028
35	NC_017261	TAA	2	6	713	718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228028
36	NC_017261	T	6	6	753	758	0 %	100 %	0 %	0 %	384228028
37	NC_017261	TAAT	2	8	797	804	50 %	50 %	0 %	0 %	384228028
38	NC_017261	ATTT	2	8	824	831	25 %	75 %	0 %	0 %	384228028
39	NC_017261	TCA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228028
40	NC_017261	GAA	2	6	901	906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228028
41	NC_017261	TTCA	2	8	963	970	25 %	50 %	0 %	25 %	384228028
42	NC_017261	TCT	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228028
43	NC_017261	T	8	8	983	990	0 %	100 %	0 %	0 %	384228028
44	NC_017261	AATTTT	2	12	999	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228028
45	NC_017261	T	7	7	1007	1013	0 %	100 %	0 %	0 %	384228028
46	NC_017261	TAATT	2	10	1027	1036	40 %	60 %	0 %	0 %	384228028
47	NC_017261	TTA	2	6	1102	1107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228028
48	NC_017261	AGG	2	6	1113	1118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384228028
49	NC_017261	A	6	6	1122	1127	100 %	0 %	0 %	0 %	384228028
50	NC_017261	GGGATT	2	12	1128	1139	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384228028
51	NC_017261	TAG	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017261	ATTA	2	8	1186	1193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017261	TTG	2	6	1196	1201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017261	AAAT	2	8	1202	1209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017261	AT	3	6	1233	1238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017261	ACTTT	2	10	1240	1249	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017261	T	9	9	1252	1260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017261	AATA	2	8	1264	1271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017261	ATT	2	6	1302	1307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017261	AAT	2	6	1311	1316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017261	ATT	2	6	1319	1324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017261	TGA	2	6	1332	1337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017261	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017261	A	9	9	1368	1376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017261	A	8	8	1392	1399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017261	A	9	9	1406	1414	100 %	0 %	0 %	0 %	384228029
67	NC_017261	A	6	6	1418	1423	100 %	0 %	0 %	0 %	384228029
68	NC_017261	AT	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	384228029
69	NC_017261	TA	3	6	1471	1476	50 %	50 %	0 %	0 %	384228029
70	NC_017261	TAT	2	6	1496	1501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228029
71	NC_017261	T	6	6	1513	1518	0 %	100 %	0 %	0 %	384228029
72	NC_017261	CAA	2	6	1519	1524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228029
73	NC_017261	TTTA	2	8	1527	1534	25 %	75 %	0 %	0 %	384228029
74	NC_017261	TTG	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228029
75	NC_017261	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	384228029
76	NC_017261	GTT	2	6	1579	1584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228029
77	NC_017261	TAG	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228029
78	NC_017261	A	6	6	1685	1690	100 %	0 %	0 %	0 %	384228029
79	NC_017261	GGAT	2	8	1696	1703	25 %	25 %	50 %	0 %	384228029
80	NC_017261	GATG	2	8	1710	1717	25 %	25 %	50 %	0 %	384228029
81	NC_017261	A	6	6	1728	1733	100 %	0 %	0 %	0 %	384228029
82	NC_017261	CAT	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228029
83	NC_017261	TAG	2	6	1751	1756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228029
84	NC_017261	TCT	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228029
85	NC_017261	ATA	2	6	1811	1816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228029
86	NC_017261	ATTAT	2	10	1819	1828	40 %	60 %	0 %	0 %	384228029
87	NC_017261	AT	3	6	1875	1880	50 %	50 %	0 %	0 %	384228029
88	NC_017261	A	6	6	1894	1899	100 %	0 %	0 %	0 %	384228029
89	NC_017261	A	6	6	1927	1932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017261	T	8	8	1937	1944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017261	TGTT	2	8	1954	1961	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017261	TATT	2	8	1998	2005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017261	ATTTT	2	10	2038	2047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017261	A	6	6	2072	2077	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
95	NC_017261	AT	3	6	2082	2087	50 %	50 %	0 %	0 %	384228030
96	NC_017261	T	6	6	2100	2105	0 %	100 %	0 %	0 %	384228030
97	NC_017261	A	9	9	2122	2130	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
98	NC_017261	TAAAT	2	10	2189	2198	60 %	40 %	0 %	0 %	384228030
99	NC_017261	TAT	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228030
100	NC_017261	T	6	6	2435	2440	0 %	100 %	0 %	0 %	384228030
101	NC_017261	A	7	7	2466	2472	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
102	NC_017261	ATA	2	6	2476	2481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228030
103	NC_017261	ATA	2	6	2484	2489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228030
104	NC_017261	A	7	7	2505	2511	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
105	NC_017261	T	6	6	2529	2534	0 %	100 %	0 %	0 %	384228030
106	NC_017261	A	9	9	2554	2562	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
107	NC_017261	ATT	2	6	2566	2571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228030
108	NC_017261	T	6	6	2570	2575	0 %	100 %	0 %	0 %	384228030
109	NC_017261	A	7	7	2584	2590	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
110	NC_017261	AGA	2	6	2606	2611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228030
111	NC_017261	A	6	6	2614	2619	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
112	NC_017261	TC	3	6	2624	2629	0 %	50 %	0 %	50 %	384228030
113	NC_017261	A	6	6	2665	2670	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
114	NC_017261	A	8	8	2678	2685	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
115	NC_017261	TAA	2	6	2698	2703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228030
116	NC_017261	ATT	2	6	2704	2709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228030
117	NC_017261	CAGC	2	8	2713	2720	25 %	0 %	25 %	50 %	384228030
118	NC_017261	A	8	8	2751	2758	100 %	0 %	0 %	0 %	384228030
119	NC_017261	GATA	2	8	2759	2766	50 %	25 %	25 %	0 %	384228030
120	NC_017261	TA	3	6	2791	2796	50 %	50 %	0 %	0 %	384228030
121	NC_017261	A	7	7	2851	2857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017261	T	7	7	2861	2867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017261	TATAA	2	10	2898	2907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017261	TAA	2	6	2915	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017261	TTTAT	2	10	2924	2933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017261	TTA	2	6	2961	2966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228031
127	NC_017261	AGCA	2	8	2994	3001	50 %	0 %	25 %	25 %	384228031
128	NC_017261	A	6	6	3135	3140	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
129	NC_017261	A	6	6	3142	3147	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
130	NC_017261	TAG	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
131	NC_017261	T	7	7	3240	3246	0 %	100 %	0 %	0 %	384228031
132	NC_017261	CAACAT	2	12	3249	3260	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384228031
133	NC_017261	A	6	6	3283	3288	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
134	NC_017261	T	6	6	3315	3320	0 %	100 %	0 %	0 %	384228031
135	NC_017261	AG	3	6	3327	3332	50 %	0 %	50 %	0 %	384228031
136	NC_017261	TGA	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
137	NC_017261	TTG	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228031
138	NC_017261	ATTT	2	8	3504	3511	25 %	75 %	0 %	0 %	384228031
139	NC_017261	CTA	2	6	3537	3542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228031
140	NC_017261	ATG	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
141	NC_017261	AGA	2	6	3670	3675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228031
142	NC_017261	AGA	2	6	3700	3705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228031
143	NC_017261	TAG	2	6	3766	3771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
144	NC_017261	TAG	2	6	3807	3812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
145	NC_017261	GTA	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
146	NC_017261	TTC	2	6	3832	3837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228031
147	NC_017261	TCA	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228031
148	NC_017261	ATT	2	6	3884	3889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228031
149	NC_017261	A	7	7	3910	3916	100 %	0 %	0 %	0 %	384228031
150	NC_017261	AGC	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228031
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247	NC_017261	ATTTT	2	10	7649	7658	20 %	80 %	0 %	0 %	384228034
248	NC_017261	TAA	2	6	7680	7685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228034

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.